Благоустройство обители велось на протяжении всего XIX столетия. В 1808 - 1817 годах были выстроены несколько каменных келейных корпусов вместо деревянных, и настоятельские покои.
В 1852-1856 годах за Покровской церковью и "у колоколенных ворот" были сооружены два новых двухэтажных корпуса, больничный и келейный; в 1861 в юго-восточной башне монастырской ограды устроили часовню.
Третья церковь монастыря была сооружена в 1878-1881 году на средства игуменьи Феофании, освящена в честь праздника Сретения Господня 2 февраля 1881 года, она считалась домовым храмом настоятельниц.
Описание её донес до нас в своих интереснейших "Воспоминаниях" житель Ярославля С. В. Дмитриев: "В ближайшее воскресенье я отправился к 6 часам утра к месту своего временного служения - в Казанский монастырь,
в домовую церковь игумений. Это была небольшая, очень уютная церковка, по стенам и потолку расписанная божественными темами; пол в церкви и алтаре сплошь устлан коврами. Тепло, светло, всё так торжественно, все
движения монахинь, все действия их в церкви производились, как будто заранее прорепетированные".
В начале ХХ века в 8 каменных и 1 деревянном корпусах проживало более 300 насельниц.
Послушницы монастыря
Фотография начала ХХ века