Храмы Предтеченского прихода были закрыты в 1929-1931 годах, а в январе 1933 года церковь Иоанна Предтечи передали
в ведение Ярославского музея.
В 1936 г. завод "Победа рабочих" включил здание храма в свою территорию, использовав
его в качестве склада зерна и химических веществ. Благодаря вмешательству Главнауки варварское использование
храма удалось приостановить.
Теплая Вознесенская церковь снесена в начале 1950-х годов.
Церковь Иоанна Предтечи ныне входит в состав Ярославского музея-заповедника.