В 1879 году комитет министров предложил земствам софинансирование строительства помещений для душевнобольных путем субсидии в размере 50
процентов от сумм, затраченных земством на строительство. Ярославское губернское земство в числе первых воспользовалось правительственной субсидией.
В 1887 году было завершено строительство шести деревянных павильонов, рассчитанных на 144 койки.
С 1890 по 1926 год психиатрическим отделением руководил Алексей Аркадьевич Малинин. Благодаря его стараниям психиатрическая помощь населению
Ярославской губернии была расширена и реорганизована.
А. А. Малинин стремился ввести прогрессивные принципы призрения и лечения. Он добивался улучшения снабжения одеждой питанием, требовал от
персонала гуманного, заботливого отношения к больным, первым в Ярославской действительности ввёл трудовую терапию и платный патронаж.
За большую плодотворную деятельность Алексей Аркадьевич в 1922 году был награждён грамотой Красного Героя Труда.
В 1918 году произошёл белогвардейский Мятеж. В результате значительный ущерб был нанесён центру города и прилегающим к нему районам.
Из пяти деревянных корпусов земской больницы, где располагались психиатрические отделения, во время мятежа сгорело четыре. Кроме того, ещё одно здание руководство больницы
вынуждено было передать под квартиры сотрудникам.