Находилась церковь на углу улиц Пробойной (ныне Советская) и Варваринской (ныне Кедрова). Варваринская церковь
существовала ещё в XIV веке, и без сомнения была деревянная. Первые документальные свидетельства о деревянной Варваринской
церкви находим в Перечневой описи города 1630 и Переписной книге 1646 года.
Каменный храм Варваринского прихода был построен в 1668 году на средства ярославского купца Семёна Васильева
Добрынина - потомка новгородских посадских людей. Жертвователь не дожил до завершения строительства каменного храма,
незадолго до своей кончины он принял постриг. Н. Г. Первухин писал: "Новгородский богатый выходец Добрынин строит огромный
храм родной иконе "Знамение, что в Великом Новеграде", чтобы было где положить его тело, уже облеченное в смиренную схиму".
Семён Добрынин был погребен в подклете Варваринской церкви, под южной папертью. Над его захоронением сохранялась доска с
надписью: "лета 7172 (1664) месяца августа в 9-й день преставился раб Божий, инок-схимник Сергий".
Главный престол церкви освятили во имя одной из самых чтимых святынь Новгорода - иконы Богоматери
"Знамение", история чуда от этого образа являлась главной темой одного из ярусов росписи холодного храма.
Роспись центрального барабана летней церкви