На колокольне Николо-Надеинского прихода висели древние колокола. Самый большой из них, благовестник, был отлит в Голландии
и весил около 100 пудов; надпись на нём сообщала: "лета 7130 (1622) поставил сей колокол в богоспасаемом граде Ярославле на
волгском берегу в дом Пречистой Богородицы честного и славного её Благовещения и св. пророка и предтечи и крестителя Господня
и во имя чудотворца Николы и преподобных отец наших: Михаила Малеина, Макария, Желтоводского чудотворца, при благоверном
государе царевиче и великом князе Михаиле Фёдоровиче, государе, всея Руси самодержце, и при великом господине Филарете,
Патриархе Московском и всея Руси, митрополите Варлааме Ростовском и Ярославском, государев гость Епифаний Ондреев сын
Светешников, прозвище Надеина, по своей душе и по своих родителях".
Надпись на втором колоколе, тоже голландского литья:
"В сей колокол Богдан Хохликов вклад 80 рублев положил, Сергей Махеев 50 рублев, Иван Голяков вклад 50 рублев, Василий
Шитарев вклад 20 рублев, Пишимо Колосов з братом вклад 15 рублев. А той колокол положили в дом Николе чудотворцу ярославцы
посадские люди по родителех своих и по детях своих".
Имелась надпись и на третьем колоколе, в 35 пудов: "Постави сей колокол
в Ярославле на волгском берегу ко Благовещению Пресвятой Богородицы и рождества во имя Предтечи и Николе чудотворцу в 7134
(1626) год Павел Ондреев Светешников по своей душе и по своих родителях".
Два последних колокола сохранились, они находятся
в собрании Ярославского историко-архитектурного и художественного музея-заповедника (входят в набор колоколов звонницы).
Иконостас главного храма, заменивший первоначальный тябловый, был сооружён в 1751 году по рисункам, выполненным первым
русским актёром Фёдором Григорьевичем Волковым, и "при усердии его отчима, купца Полушкина, и прочих горожан".

Интерьер церкви Николы Надеина. 2011 год