Богоявленский храм был освящён 2 июля 1693 года в честь праздника Богоявления; его южный придел, служивший тёплой церковью,
освятили еще в ходе строительства, о чём сообщала не сохранившаяся до настоящего времени надпись на деревянном резном
кресте из Богоявленского храма: "Освятися олтарь Господа Бога и Спаса нашего Иисуса Христа и водружен бысть крест сей в
церкви преподобного и богоносного отца нашего Димитрия иже на Прилуке вологодского чудотворца в лето 7194 [1686] месяца
генваря в 24 день при благоверном царе и великом князе Иоанне Алексеевиче и великом князе Петре Алексеевиче всея великия и
Малыя и Белыя России самодержцах". Северный придел - в воспоминание Страшного суда Христова был освящен в 1697 году.
Стенописи центрального объёма церкви Богоявления исполнила в 1692-1693 годах артель ярославских мастеров,
которую предположительно возглавляли Дмитрий Григорьев Плеханов и Фёдор Игнатьев. В 1860-е годы была поновлена живопись в
алтаре, в 1950-е годы красочный слой во всем храме был укреплён и промыт В. Брюсовой и А. Рогозиным.