Во время подавления восстания в июле 1918 года храм получил значительные повреждения: в южной стене здания пробита большая брешь, повреждена колокольня, иконостас, иконы, богослужебные книги, паникадила, облачения, хоругви,
утварь - всё попорчено от снарядов, изорвано осколками. Благодаря произведённым осенью 1918 года неотложным восстановительным работам он был спасён от полного разрушения. В 1922 году храм был закрыт. С 1980 года в нём размещается
отдел реставрации Ярославского художественного музея.
В церкви Николы Рубленого после артобстрелов в июле 1918 года